鎖国時代、日本と西欧を結ぶ唯一の窓口であった出島は、経済・文化・学術の交流拠点として、日本の近代化に大きな役割を果たしました。しかし、明治以降、出島周辺の埋め立てが進み、明治37年の第2期港湾改良工事により、海に浮かぶ扇形の原形を失ってしまいました。出島は、日本だけではなく世界史上においても貴重な歴史的遺産であり、その復元は市民はもちろん、国内外の多くの人々が待ち望んでいます。
　出島は大正11年に国の史跡に指定されました。長崎市では昭和26年度から整備計画に着手し、昭和27年度以来、史跡内の民有地の公有化や施設整備に取り組んでいます。
　これまで研究会や審議会での検討を経て、平成8年度からは本格的な復元整備事業を実施。平成13年度には民有地のすべてを公有化するなど、完全復元に向けて整備は着々と進んでいます。

昭和53年 長崎市出島史跡整備審議会の設置
昭和57年 史跡の長期的かつ総合的復元整備構想についての答申
平成 4年 長崎市出島史跡復元整備研究会の設置、整備基本案の策定
平成 6年 第2次長崎市出島史跡整備審議会の設置、短中期・長期計画
原案の提示
平成 8年 審議会の答申、本格的な復元整備事業スタート


●短中期計画●

3段階にわけて建物などを復元します！
　短中期計画では、出島の「西・北」「中央」「東・南」の各ゾーンの順に、3段階に分けて鎖国時代の建物などの復元整備を行います。建物の復元により、当時の出島の町並みなどを体験することができ、復元した建物内の展示により、当時の人々の暮らしぶりを知ることができます。
［第1段階］
西・北ゾーン 出島の代表的な建物だったカピタン部屋（商館長居宅）や水門など10棟を復元、建物と家具・調度品などにより、当時の生活や貿易のようすなどを紹介する展示を行います。

［第2段階］
中央ゾーン 日本人用の家屋や土蔵など10棟を復元。地役人の仕事のようすなどを紹介します。

［第3段階］
東・南ゾーン 病室やカピタン別荘など5棟を復元。通りや街灯、家具・調度品などの展示整備により、生活感のある町をつくります。
　
●長期計画●

出島が完全によみがえる！
　長期計画では、四方に水面を確保し、19世紀初めの扇形の島を完全に復元します。
［北側］
出島北面を復元するため、中島川を江戸町側へ振り替え、中島川公園の再整備を行います。

［西側］
荷揚場を復元し、水面を確保して出島の形を再現するために、国道499号線を西側へ移動させます。

［南側］
銅座川の流れを一部変更して海に通じる水路を設置。出島を中心とした市街地環境を整備します。

［建物など］
建物や庭園を復元、建物の内部については、より充実した展示活用を行います。