第１駐車場から水族館までの２００メートルの園路周辺が自然体験ゾーン。
里山を復元し、落葉樹、常緑樹の森、池、小川がつくられています。ここに生息する生き物は動植物ともすべて、長崎に本来生息しているものばかりです。
絶滅の危機に瀕している野生のメダカを自然なかたちでふやしていったり、草むらの小さな虫を観察したり、四季につれて移り変わる木々や草花を眺めたり、こころゆくまで遊んで下さい。自然体験ゾーンのお世話をするボランティアも募集しています。
＊自然体験ゾーンは入場無料です。

自然体験ゾーンの移り変わりはこちらで見ることができます。